Підготовка до УЗД ШКТ дуже важлива для того, щоб результати були точними. Зазвичай, перед процедурою пацієнтам рекомендують не їсти за 6–8 годин до обстеження, щоб шлунок і кишечник були порожніми. Це дозволяє отримати чітке зображення органів, без зайвих перешкод, таких як гази чи залишки їжі. Також часто просять не пити воду перед дослідженням, якщо це не вказано інакше лікарем, оскільки заповнений шлунок може утруднювати проведення процедури.